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Reasearch Fellowship (BI) m/f -BIOPOLIS 2024-49 WOLFNESS Job description: Reference: BIOPOLIS 2024-49 Job: Research fellowship (BI) Main Scientific Area: Biological Sciences Associação BIOPOLIS (CIBIO) is opening a call for one Research Fellowship in the framework of the project Preserving the natural heritage of wolves: a multidisciplinary approach towards effective and socially acceptable management of wolf-dog hybridization across Europe (WOLFNESS; DivProtect/0012/2021), funded by FCT through the EU BioDiversa+ Programme. The fellowship is framed in the field of molecular and evolutionary biology, and specifically aims to optimize an amplicon sequencing protocol for genotyping a panel of Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) available for canids and applicable to non-invasive DNA samples. This panel will then be used to assess the prevalence and dynamics of wolf-dog hybridization in the Iberian Peninsula. The selected candidate will carry out wet lab work, including DNA extraction from non-invasive samples and library preparation for Illumina sequencing. Additionally, the candidate will implement bioinformatics pipelines for primer design, PCR multiplexing, and raw data analysis from high-throughput sequencing. 1. Admission requirements and competencies: Candidates should hold a MSc degree in Evolutionary Biology, must be attending an advanced course program in the area of Biological Sciences, and should prove relevant experience in laboratory work related to non-invasive genetics. We seek candidates with i) experience in working with non-invasive samples; ii) skills in genetic data analysis; iii) good oral and written communication skills both in English and in Portuguese; and iv) highly motivated and having teamwork skills. The candidate’s Curriculum Vitae must be compatible with the work plan. It will be also valued presentations at conferences in Evolutionary Biology and international experience. 2. Working plan: The researcher will join the WOLFNESS team, both national and international. The following tasks will be conducted: i) DNA extraction and library preparation of non-invasive samples for Illumina sequencing; ii) primer design and optimization of PCR multiplexes for SNP genotyping; iii) bioinformatic analysis of raw data from high throughput sequencing; 4) assessment of the prevalence and dynamics of wolf-dog hybridization using the SNP data generated; and iv) report writing. The work will be developed under the scientific supervision of Raquel Godinho (PI in BIOPOLIS) and in close collaboration with the WOLFNESS team. 3. Applicable legislation: Law nº.40/2004, 18th August (Research Fellow Statute) amended and republished by Decreto-Lei n.º 123/2019, 28th August; FCT Regulation for Research Studentships and Fellowships ( https://www.fct.pt/apoios/bolsas/regulamento.phtml.pt ). 4. Workplace: The scholarship fellow will be based at the headquarters of Associação BIOPOLIS, CIBIO, Campus de Vairão, Rua Padre Armando Quintas, 7, Vairão, Portugal, and may involve travel in Portugal and abroad in service. 5. Duration of the fellowship: The fellowship will have a duration of 6 months, potentially renewable for additional period. 6. Monthly stipend: Monthly stipend is €1.259,64 according to the stipends established by FCT, I.P. in Portugal ( https://www.fct.pt/wp-content/uploads/2024/02/Tabela-de-Valores-SMM_atualizacao-2024.pdf ). Payment will be made by bank transfer on a monthly basis. The successful candidate will also be entitled to the reimbursement of Social Security payments (Seguro Social Voluntário) and accident insurance. 7. Selection methods: The ranking of candidates will be assessed in accordance with admission requirements and will be based on: a) documental appreciation of the Curriculum Vitae (40%); b) previous experience of the candidate relevant to the project (50%), and motivation letter (10%). The candidate's final classification system shall be given based on a scale of 0 to 100. The jury may interview a short list of candidates to establish the final ranking if the difference between the classification of the top two candidates is less than 10 points. The jury may not award the fellowship if the profile of the candidates does not meet the requirements of the project. 8. Composition of the jury: President of the jury: Raquel Godinho Jury member: Diana Lobo Jury member Rita G. Rocha Substitute jury member: Orlando Gallo 9. Advertising and notification of the results: C andidates will be informed by email about the result of their application. 10. How to apply and deadline for application: The call is open from 07/10/2024 to 14/10/2024 (24:00 GMT). Applications are formalized at the electronic address https://www.cibio.up.pt/en/jobs/ with the following documents in digital format (PDF): The supporting documentation must include (all documents in English and PDF format): i. Curriculum Vitae, including the candidate's e-mail address and phone number; ii. Motivation Letter (max two pages) that includes a brief description of research experience and why the candidate feels suitable for the announced position. iii. Copy of academic certificates. iv. Proof of attending an advanced course or declaration of honour stating the attendance at the beginning of the fellowship Expect starting date: 1 st November 2024 11. Non-discrimination and equal access policy: The Association BIOPOLIS is committed to providing equal opportunity in employment. Association BIOPOLIS actively promotes employees and applicants to a policy of non-discrimination and equal access, in which no applicant may be privileged, benefited, prejudiced, or deprived of any right or exempt from any duty, namely, sex, age, nationality, religion, sexual orientation, gender identity or expression, marital status, citizenship, disability, ancestry, family status, economic situation, education, origin or social condition, reduced work capacity, disability, chronic illness, nationality, political or ideological beliefs, union membership, or any other legally protected factor. ------------------------------------------------------------------------------------------------PT--------------------------------------------------------------------------------------------------------- Referencia: BIOPOLIS 2024-49 Posição: Bolsa de Investigação (BI) Área Científica: Ciências Biológicas A Associação BIOPOLIS abre concurso para uma Bolsa de Investigação no âmbito do projeto " Preservar o património natural dos lobos: uma abordagem multidisciplinar para uma gestão eficaz e socialmente aceitável da hibridização cão-lobo na Europa (WOLFNESS; DivProtect/0012/2021)” , financiado pelo programa BioDiversa+ e cofinanciado por Fundos Nacionais através da FCT – Fundação para a Ciência e Tecnologia. A bolsa insere-a na área da biologia evolutiva e molecular, cujo objetivo visa otimizar um protocolo de amplificação e sequenciação para genotipagem de um painel de polimorfismos de nucleótido único (SNPs) disponível para canídeos e aplicável a amostras não invasivas. Este painel de SNPs será depois utilizado para estimar a prevalência e dinâmicas de hibridação lobo-cão na Península Ibérica. O candidato selecionado realizará trabalho laboratorial, incluindo extração de DNA de amostras não invasivas e preparação de biblioteca para sequenciação em plataforma de alto rendimento. Além disso, o candidato implementará análises bioinformáticas para o desenho de primers , multiplexes de amplificação, e análise de dados de sequenciação. 1. Requisitos de admissão e competências : Os candidatos devem ter mestrado em Biologia Evolutiva, estar inscritos num curso avançado na área de Ciências Biológicas, e comprovar experiência relevante em trabalho laboratorial. Procuramos candidatos com i) experiência com amostras não invasivas; ii) experiência em análise de dados genéticos; iii) boas capacidades de comunicação oral e escrita em inglês e português; e iv) altamente motivados e com capacidade de trabalho em equipa. O Curriculum Vitae do candidato deve ser compatível com o plano de trabalho. Também serão valorizadas apresentações em conferências em Biologia Evolutiva ou outras e experiência internacional. 2. Plano de trabalho : O candidato vai juntar-se à equipa do WOLFNESS, tanto nacional como internacional. As seguintes tarefas serão desenvolvidas: i) extração de DNA e preparação de bibliotecas de amostras não invasivas para sequenciação de alto rendimento; ii) desenho de primers e otimização de multiplexes de amplificação para genotipagem de SNPs; iii) análise bioinformática de dados de sequenciação de alto rendimento; 4) estimativa da prevalência e dinâmica da hibridização lobo-cão usando os dados gerados; e iv) escrita de relatórios. O trabalho será desenvolvido sob a supervisão científica da Dra. Raquel Godinho (Investigadora Principal no BIOPOLIS-CIBIO) e em estreita colaboração com a equipa do WOLFNESS. 3. Legislação aplicável: Lei nº.40/2004, de 18 de Agosto (Estatuto do Bolseiro de Investigação) alterada e republicada pelo Decreto-Lei n.º 123/2019, de 28 de Agosto; Regulamento de 4. Local: O trabalho será realizado na sede da Associação BIOPOLIS e do CIBIO, na Rua Padre Armando Quintas nº7 | 4485-661 Vairão, PORTUGAL, podendo envolver viagens em Portugal ou no estrangeiro ao serviço ou representação da entidade empregadora. 5. Duração da bolsa: 6 meses eventualmente renovável por igual período. 6. Subsídio de manutenção mensal: A bolsa mensal é de €1.259,64 de acordo com os valores estabelecidos pela O pagamento será efetuado mensalmente por transferência bancária. O candidato selecionado também terá direito ao reembolso das prestações da Segurança Social (Seguro Social Voluntário) e a um seguro de acidentes de trabalho. 7. Critérios de seleção: A avaliação dos candidatos será efetuada de acordo com os requisitos de admissão e basear-se-á em i) qualidade do Curriculum Vitae (40%); b) relevância da experiência anterior relativa às tarefas do plano de trabalhos (50%); e c) carta de motivação (10%). A classificação final dos candidatos será atribuída numa escala de 0 a 100. No caso dos candidatos admitidos cuja avaliação não difira em mais de 10% da obtida pelo candidato melhor posicionado, o júri procederá a uma entrevista a esses candidatos. O júri poderá não atribuir a bolsa se a qualidade dos candidatos for inferior à pretendida. 8. Composição do Júri Presidente: Dra. Raquel Godinho (BIOPOLIS) Vogal efetivo: Dra. Diana Lobo (BIOPOLIS) Vogal efetivo: Dra. Rita G. Rocha (BIOPOLIS) Vogal de substituição: Dr. Orlando Gallo (BIOPOLIS). 9. Publicidade e comunicação de resultados: t odos os candidatos serão informados por correio eletrónico do resultado da sua candidatura. 10. Candidatura e prazos: O período de candidaturas está aberto entre 07 /10/2024 e 14/10/2024 (24:00 GMT). As candidaturas são formalizadas no endereço eletrónico https://www.cibio.up.pt/en/jobs/ com os seguintes documentos em suporte digital, em formato PDF, e redigidos em inglês: i. Curriculum Vitae, incluindo o email e contato telefónico do candidato. ii. Carta de motivação (máximo 2 páginas), com uma breve descrição da experiência de investigação e a razão pela qual o candidato acredita ser adequado para a posição. iii. Cópia dos certificados de habilitações. iv. Prova de inscrição num curso avançado ou declaração de honra de inscrição no início da bolsa. Data de início: 1 de Novembro de 2024 11. Política de não discriminação e de igualdade de acesso: A Associação BIOPOLIS, promove ativamente uma política de não discriminação e de igualdade de acesso, pelo que nenhum candidato/a pode ser privilegiado/a, beneficiado/a, prejudicado/a ou privado/a de qualquer direito ou isento/a de qualquer dever em razão, nomeadamente, de sexo, idade, nacionalidade, religião, orientação sexual, identidade de género, estado civil, deficiência, património genético, situação familiar, situação económica, instrução, origem ou condição social, capacidade de trabalho reduzida, d